Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTRB1P17538 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTRB1P17538 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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