Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms