Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms