Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MED27Q6P2C8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms