Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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