Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms