Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRAV9-2A0A087WT02 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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