Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAV9-2A0A087WT02 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAV9-2A0A087WT02 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAV9-2A0A087WT02 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAV9-2A0A087WT02 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAV9-2A0A087WT02 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAV9-2A0A087WT02 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV9-2A0A087WT02 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAV9-2A0A087WT02 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAV9-2A0A087WT02 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAV9-2A0A087WT02 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAV9-2A0A087WT02 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV9-2A0A087WT02 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV9-2A0A087WT02 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV9-2A0A087WT02 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAV9-2A0A087WT02 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV9-2A0A087WT02 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAV9-2A0A087WT02 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV9-2A0A087WT02 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAV9-2A0A087WT02 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAV9-2A0A087WT02 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAV9-2A0A087WT02 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV9-2A0A087WT02 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV9-2A0A087WT02 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV9-2A0A087WT02 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV9-2A0A087WT02 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAV9-2A0A087WT02 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAV9-2A0A087WT02 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV9-2A0A087WT02 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV9-2A0A087WT02 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV9-2A0A087WT02 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV9-2A0A087WT02 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV9-2A0A087WT02 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAV9-2A0A087WT02 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV9-2A0A087WT02 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV9-2A0A087WT02 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV9-2A0A087WT02 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAV9-2A0A087WT02 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV9-2A0A087WT02 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV9-2A0A087WT02 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV9-2A0A087WT02 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV9-2A0A087WT02 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV9-2A0A087WT02 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV9-2A0A087WT02 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV9-2A0A087WT02 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV9-2A0A087WT02 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV9-2A0A087WT02 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV9-2A0A087WT02 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV9-2A0A087WT02 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV9-2A0A087WT02 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV9-2A0A087WT02 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV9-2A0A087WT02 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV9-2A0A087WT02 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV9-2A0A087WT02 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV9-2A0A087WT02 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV9-2A0A087WT02 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV9-2A0A087WT02 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAV9-2A0A087WT02 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV9-2A0A087WT02 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV9-2A0A087WT02 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAV9-2A0A087WT02 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAV9-2A0A087WT02 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAV9-2A0A087WT02 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAV9-2A0A087WT02 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAV9-2A0A087WT02 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAV9-2A0A087WT02 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAV9-2A0A087WT02 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAV9-2A0A087WT02 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV9-2A0A087WT02 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV9-2A0A087WT02 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV9-2A0A087WT02 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV9-2A0A087WT02 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV9-2A0A087WT02 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV9-2A0A087WT02 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV9-2A0A087WT02 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV9-2A0A087WT02 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV9-2A0A087WT02 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV9-2A0A087WT02 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV9-2A0A087WT02 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV9-2A0A087WT02 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV9-2A0A087WT02 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV9-2A0A087WT02 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV9-2A0A087WT02 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV9-2A0A087WT02 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV9-2A0A087WT02 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV9-2A0A087WT02 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV9-2A0A087WT02 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV9-2A0A087WT02 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV9-2A0A087WT02 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV9-2A0A087WT02 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV9-2A0A087WT02 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV9-2A0A087WT02 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAV9-2A0A087WT02 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAV9-2A0A087WT02 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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