Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHPF2Q9P2E5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms