Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf109Q9NX04 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms