Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFXN2Q96NB2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms