Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC9B1Q4ZJI4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms