Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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