Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HERVK_113P61574 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms