Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTC7AQ9ULT0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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