Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms