Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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