Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 POGZ-210ENST00000476128 397 ntTSL 58.29□□□□□ -1.087e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.257e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 POGZ-202ENST00000358476 6459 ntTSL 27.13□□□□□ -1.277e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 SLC16A3-218ENST00000583444 2882 nt22.52■■□□□ 1.21e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 TMEM214-212ENST00000478980 572 ntTSL 210.15□□□□□ -0.788e-38■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.684e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.234e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.134e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.094e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.84e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-7■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 517.32■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 311.01□□□□□ -0.652e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.932e-6■■■□□ 16.8
GTF2F1P35269 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 317.8■□□□□ 0.441e-9■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 510.19□□□□□ -0.781e-9■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)23.36■■□□□ 1.336e-7■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 520.98■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 515.08■□□□□ 02e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 526.62■■□□□ 1.852e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 NEU4-216ENST00000494678 491 ntTSL 421.51■■□□□ 1.037e-7■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 323.33■■□□□ 1.332e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 312.51□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.13e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.433e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 IFNGR2-205ENST00000439213 906 ntTSL 523.5■■□□□ 1.353e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.193e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.114e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.13e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 520.81■□□□□ 0.923e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.863e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.383e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TFCP2-203ENST00000548108 1508 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.233e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 HIPK1-206ENST00000369559 3424 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.444e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.014e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.134e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.334e-13■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.012e-8■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 221.63■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-205ENST00000504168 884 ntTSL 526.53■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.662e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.642e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.412e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-203ENST00000503030 909 ntTSL 318.24■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-208ENST00000514705 4445 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 TSPAN17-206ENST00000507471 707 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 16.7
GTF2F1P35269 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 218.17■□□□□ 0.53e-9■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.462e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.152e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-214ENST00000578577 1511 ntTSL 222■■□□□ 1.112e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-218ENST00000580551 554 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.822e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-223ENST00000583582 1350 ntTSL 219.65■□□□□ 0.742e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-212ENST00000578254 562 ntTSL 519.06■□□□□ 0.642e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-216ENST00000579479 560 ntTSL 418.76■□□□□ 0.592e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 418.76■□□□□ 0.592e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-203ENST00000443521 673 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-228ENST00000585214 566 ntTSL 418.12■□□□□ 0.492e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-207ENST00000484773 916 ntTSL 318.08■□□□□ 0.482e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-211ENST00000578232 851 ntTSL 217.92■□□□□ 0.462e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-225ENST00000583718 550 ntTSL 417.85■□□□□ 0.452e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-221ENST00000582874 591 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-204ENST00000460894 584 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 416.91■□□□□ 0.32e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-220ENST00000581894 591 ntTSL 316.43■□□□□ 0.222e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 STARD3-217ENST00000580331 558 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-13■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TMEM183A-204ENST00000488097 555 ntTSL 59.41□□□□□ -0.98e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.64□□□□□ -1.672e-6■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.356e-9■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.016e-9■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.156e-9■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-9■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-9■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 FOXP4-206ENST00000451305 367 ntTSL 1 (best)18.61■□□□□ 0.573e-6■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.112e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 517.8■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.222e-7■■■□□ 16.6
GTF2F1P35269 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 16.6
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