RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504168.5

TSPAN17-205, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN17, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN17-205ENST00000504168 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.92■■■■■ 4.62
TSPAN17-205ENST00000504168 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.91■■■■■ 4.62
TSPAN17-205ENST00000504168 WDR62O43379 1518 aa43.85■■■■■ 4.61
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TSPAN17-205ENST00000504168 TOPBP1Q92547 1522 aa43.19■■■■■ 4.5
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TSPAN17-205ENST00000504168 IFT140Q96RY7 1462 aa43■■■■■ 4.47
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TSPAN17-205ENST00000504168 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.61■■■■■ 4.41
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TSPAN17-205ENST00000504168 WDR97A6NE52 1622 aa42.4■■■■■ 4.38
TSPAN17-205ENST00000504168 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
TSPAN17-205ENST00000504168 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.37
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TSPAN17-205ENST00000504168 GRIN2BQ13224 1484 aa42.14■■■■■ 4.34
TSPAN17-205ENST00000504168 PBRM1Q86U86 1689 aa42.13■■■■■ 4.34
TSPAN17-205ENST00000504168 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.11■■■■■ 4.33
TSPAN17-205ENST00000504168 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.08■■■■■ 4.33
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TSPAN17-205ENST00000504168 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
TSPAN17-205ENST00000504168 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
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TSPAN17-205ENST00000504168 ARAP1Q96P48 1450 aa41.57■■■■■ 4.25
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TSPAN17-205ENST00000504168 SHROOM2Q13796 1616 aa41.25■■■■■ 4.19
TSPAN17-205ENST00000504168 IGF1RP08069 1367 aa41.25■■■■■ 4.19
TSPAN17-205ENST00000504168 CUL7Q14999 1698 aa41.23■■■■■ 4.19
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TSPAN17-205ENST00000504168 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.98■■■■■ 4.15
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