Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGB2P05107 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB2P05107 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms