Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms