Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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