Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms