Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms