Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms