Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 517.22■□□□□ 0.351e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 SNRNP40-207ENST00000491106 459 ntTSL 22.43□□□□□ -2.024e-12■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.441e-39■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-39■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 NKIRAS2-203ENST00000393879 4213 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.663e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-209ENST00000634259 825 ntTSL 514.02□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-204ENST00000635160 692 ntTSL 49.04□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-210ENST00000635593 668 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-213ENST00000634538 924 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-208ENST00000635511 920 ntTSL 58.46□□□□□ -1.062e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-211ENST00000560278 595 ntTSL 48.46□□□□□ -1.062e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-205ENST00000635704 670 ntTSL 37.43□□□□□ -1.222e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.392e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 55.96□□□□□ -1.462e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-214ENST00000635320 568 ntTSL 45.82□□□□□ -1.482e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-212ENST00000635413 706 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-206ENST00000635605 757 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-215ENST00000558783 726 ntTSL 54.65□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC087632.1-207ENST00000634529 372 ntTSL 43.92□□□□□ -1.782e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.042e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.686e-35■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTP1-205ENST00000494593 1681 ntTSL 222.59■■□□□ 1.216e-35■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.316e-35■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.671e-19■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TSC22D2-203ENST00000466814 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.011e-19■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.41e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PRKACA-202ENST00000350356 3105 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 NUCB1-212ENST00000492367 1515 ntTSL 221.75■■□□□ 1.073e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 228.74■■■□□ 2.191e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.861e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.41e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RPL8-214ENST00000534781 716 ntTSL 217.95■□□□□ 0.463e-46■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 523.68■■□□□ 1.385e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.465e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 515.72■□□□□ 0.115e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RHBDD2-204ENST00000454791 1831 ntTSL 228.95■■■□□ 2.234e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.034e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.414e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ELMSAN1-208ENST00000476562 5314 ntTSL 223.21■■□□□ 1.316e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.396e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.334e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ZCRB1-205ENST00000552673 907 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-15■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.446e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)23.84■■□□□ 1.416e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 519.02■□□□□ 0.636e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 518.54■□□□□ 0.566e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 212.74□□□□□ -0.376e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 220.9■□□□□ 0.944e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.824e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 414.75□□□□□ -0.054e-9■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-11■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.835e-11■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.591e-11■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C19orf81-203ENST00000490451 477 ntTSL 222.77■■□□□ 1.241e-11■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.663e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 C19orf81-202ENST00000458538 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.44■□□□□ 0.541e-11■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.468e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.18e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 HSD17B10-204ENST00000477706 556 ntTSL 312.58□□□□□ -0.44e-10■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 528.68■■■□□ 2.188e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.178e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.148e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.068e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.668e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.628e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.498e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.268e-8■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt22.86■■□□□ 1.252e-10■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 221.92■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 221.61■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.683e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-34■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CDK16-205ENST00000462483 527 ntTSL 29.8□□□□□ -0.843e-6■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-7■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 TMEM258-205ENST00000540434 553 ntTSL 213.6□□□□□ -0.238e-27■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CCNI-205ENST00000507788 595 ntTSL 419.76■□□□□ 0.751e-24■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 PSMD4-211ENST00000476855 1232 ntTSL 218.3■□□□□ 0.521e-24■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CCNI-209ENST00000515790 390 ntTSL 213.24□□□□□ -0.291e-24■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CCNI-207ENST00000513774 517 ntTSL 49.6□□□□□ -0.871e-24■■■□□ 15.4
PABPC4Q13310 CCNI-203ENST00000505609 541 ntTSL 47.79□□□□□ -1.161e-24■■■□□ 15.4
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 204.3 ms