Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG7P83436 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COG7P83436 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COG7P83436 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG7P83436 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG7P83436 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG7P83436 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG7P83436 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COG7P83436 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COG7P83436 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms