Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms