Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms