Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms