Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms