Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP25P60880 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms