Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASKO14936 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASKO14936 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms