Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L4A6NDZ8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L4A6NDZ8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms