Protein–RNA interactions for Protein: Q15040

JOSD1, Josephin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1Q15040 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JOSD1Q15040 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms