Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms