Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms