Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms