Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB5P28074 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms