Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCARF2Q96GP6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms