Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms