Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 416.34■□□□□ 0.211e-10■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 STK11IP-201ENST00000413891 880 ntTSL 515.87■□□□□ 0.131e-17■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-15■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.235e-9■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.35e-9■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 GNL3-207ENST00000474423 567 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.572e-15■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-15■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 DLEU2-202ENST00000421758 692 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.752e-15■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 DLEU2-204ENST00000433070 698 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 ERGIC2-203ENST00000546839 1274 ntTSL 59.88□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 SLC10A7-205ENST00000507030 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 AP2A2-217ENST00000529818 549 ntTSL 49.17□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.952e-15■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 DLEU2-206ENST00000449579 791 ntTSL 28.98□□□□□ -0.972e-15■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 USP54-207ENST00000451492 509 ntTSL 48.25□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 CCNE1-206ENST00000576532 1085 ntTSL 58.24□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 26.59□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 COMMD3-BMI1-203ENST00000475460 508 ntTSL 26.51□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.392e-15■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 RSRC2-203ENST00000392442 928 ntTSL 34.75□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.795e-6■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 HERC1-206ENST00000559996 443 ntTSL 27.65□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.295e-8■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 KIAA1217-205ENST00000376456 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.09□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 TRIM27-203ENST00000414543 1813 ntTSL 38.12□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 KIAA1217-210ENST00000438429 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.59□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.079e-9■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-9■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)3.9□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 WIPI1-206ENST00000589316 1886 ntTSL 515.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 WIPI1-207ENST00000589459 1804 ntTSL 514.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 218.84■□□□□ 0.617e-11■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.287e-11■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.267e-11■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.167e-11■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 215.52■□□□□ 0.077e-11■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.187e-11■■■■■ 31
PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-11■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.537e-11■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.337e-11■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 DDX52-210ENST00000613633 776 ntTSL 36.89□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 31
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