Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HTR2AP28223 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR2AP28223 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms