Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms