Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
LAMC3Q9Y6N6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC43.44■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
LAMC3Q9Y6N6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
LAMC3Q9Y6N6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
LAMC3Q9Y6N6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
LAMC3Q9Y6N6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms