Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN10AQ9Y5Y9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCN10AQ9Y5Y9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms