Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHGB5Q9Y5G0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1115 ms