Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB5Q9Y5E4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB5Q9Y5E4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB5Q9Y5E4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms