Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KIF3AQ9Y496 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF3AQ9Y496 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms