Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG3Q9Y2Y8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRG3Q9Y2Y8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms